Task

chr14:31978765-33030774

0ca1691e-8f7d-4f29-80cd-ecece5611c2f
Submitted at: June 24, 2024, 7:15 a.m.
Task status: Finished
Number of beads: 526
Number of restraints: 1705
Initial Structure type: self-avoiding random walk
Excluded volume: True
Refinement: No
Stiffness: 10.0 kJ/mol/rad2
Structure energy: 894401.143 kJ/mol
Beads per interaction: 0.309 beads/interaction
base pairs per interaction: 588 bp/interaction
Region: chr14:31978765-33030774
Region length: 1 052 010 bp
Effective resolution: 2000 bp/bead

Up to 255 characters

Values between 0 and 100 are suitable for most cases.

Diameter of container in σ (bead diameter) units. Leave empty for modelling without this constraint.

May significantly extend computation time.

Check to include ev term

The limits are: 5 - 2000

Values between 1000 - 100 000 are usually reasonable and strongly depend on size of modelling region

Genomic region in format chrN:xxx-yyy

BEDPE format.

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arc diagram
Arc height is proportional to it's length.
Restraints
  • 213 254
  • 453 520
  • 209 361
  • 209 525
  • 486 503
  • 246 254
  • 368 493
  • 229 361
  • 372 525
  • 177 183
  • 244 371
  • 18 336
  • 329 461
  • 282 443
  • 35 58
  • 267 372
  • 265 280
  • 265 269
  • 283 341
  • 315 526
  • 173 345
  • 419 468
  • 339 345
  • 369 375
  • 246 348
  • 229 328
  • 1 84
  • 77 283
  • 198 340
  • 10 474
  • 451 503
  • 283 429
  • 1 122
  • 161 196
  • 41 373
  • 436 449
  • 283 425
  • 287 372
  • 444 469
  • 327 498
  • 368 373
  • 184 398
  • 484 504
  • 238 371
  • 149 166
  • 389 398
  • 261 403
  • 192 241
  • 237 243
  • 96 167
  • 102 107
  • 118 271
  • 15 24
  • 366 492
  • 52 59
  • 335 370
  • 218 283
  • 399 481
  • 421 487
  • 17 373
  • 198 220
  • 284 347
  • 373 377
  • 184 189
  • 31 193
  • 157 177
  • 72 521
  • 283 367
  • 282 333
  • 257 278
  • 372 386
  • 362 432
  • 368 405
  • 402 414
  • 194 285
  • 490 522
  • 208 270
  • 7 433
  • 403 505
  • 349 394
  • 129 185
  • 140 253
  • 424 440
  • 302 379
  • 197 202
  • 210 373
  • 176 194
  • 368 481
  • 442 526
  • 449 526
  • 353 357
  • 373 476
  • 373 456
  • 231 469
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  • 209 263
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  • 202 243
  • 373 465
  • 264 270
  • 8 200
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  • 1 523
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  • 233 391
  • 372 521
  • 10 511
  • 425 486
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  • 208 481
  • 283 357
  • 223 526
  • 163 373
  • 2 82
  • 1 233
  • 17 22
  • 149 158
  • 235 366
  • 256 277
  • 443 526
  • 4 232
  • 284 351
  • 156 177
  • 447 457
  • 335 473
  • 282 351
  • 61 482
  • 492 496
  • 296 310
  • 415 420
  • 82 92
  • 197 245
  • 462 470
  • 206 318
  • 421 428
  • 101 209
  • 254 269
  • 240 247
  • 106 155
  • 242 485
  • 16 435
  • 417 472
  • 173 187
  • 467 476
  • 200 269
  • 420 504
  • 210 462
  • 238 372
  • 418 480
  • 189 361
  • 484 503
  • 3 112
  • 6 371
  • 190 203
  • 354 368
  • 238 275
  • 200 245
  • 459 512
  • 277 359
  • 177 182
  • 8 44
  • 210 330
  • 386 450
  • 96 158
  • 178 318
  • 195 373
  • 283 287
  • 250 258
  • 93 212
  • 112 228
  • 265 526
  • 277 284
  • 110 114
  • 45 60
  • 240 272
  • 338 342
  • 215 233
  • 1 98
  • 465 475
  • 61 84
  • 20 27
  • 313 368
  • 281 477
  • 269 478
  • 336 494
  • 119 373
  • 459 463
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  • 260 302
  • 249 349
  • 281 439
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  • 412 480
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  • 282 358
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  • 371 526
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  • 227 456
  • 479 503
  • 1 368
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  • 297 311
  • 60 84
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  • 207 368
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  • 9 260
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  • 294 301
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  • 193 209
  • 407 411
  • 373 412
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  • 97 102
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  • 87 94
  • 113 165
  • 278 351
  • 281 371
  • 318 323
  • 215 243
  • 332 343
  • 309 314
  • 277 482
  • 280 372
  • 84 232
  • 146 211
  • 108 147
  • 30 64
  • 24 37
  • 481 486
  • 173 243
  • 372 405
  • 351 372
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  • 13 49
  • 23 31
  • 2 280
  • 128 195
  • 221 481
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  • 283 369
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  • 326 385
  • 119 123
  • 453 460
  • 284 341
  • 205 373
  • 283 415
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  • 94 112
  • 403 437
  • 24 149
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  • 292 307
  • 283 392
  • 82 89
  • 139 372
  • 19 361
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  • 328 463
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  • 109 138
  • 224 283
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  • 348 460
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  • 340 347
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  • 191 269
  • 331 337
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  • 440 515
  • 256 367
  • 253 289
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  • 429 481
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  • 202 372
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  • 402 526
  • 173 185
  • 281 526
  • 191 203
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  • 241 255
  • 282 369
  • 213 524
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  • 311 447
  • 285 517
  • 275 486
  • 480 526
  • 2 69
  • 397 402
  • 346 357
  • 1 26
  • 136 453
  • 27 103
  • 118 176
  • 432 483
  • 365 370
  • 284 324
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  • 346 372
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  • 257 283
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  • 373 488
  • 429 494
  • 2 367
  • 2 524
  • 126 376
  • 1 198
  • 1 197
  • 3 319
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  • 217 437
  • 74 131
  • 20 525
  • 372 376
  • 252 263
  • 422 444
  • 26 42
  • 227 370
  • 372 438
  • 283 482
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  • 392 406
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  • 257 373
  • 333 375
  • 414 422
  • 177 267
  • 374 378
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  • 235 260
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  • 284 413
  • 212 359
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  • 74 232
  • 1 322
  • 254 372
  • 1 72
  • 480 504
  • 371 437
  • 157 337
  • 80 320
  • 69 482
  • 256 371
  • 320 340
  • 297 328
  • 357 482
  • 416 466
  • 224 278
  • 119 147
  • 274 523
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  • 209 397
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  • 305 316
  • 306 349
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  • 284 503
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  • 1 466
  • 245 389
  • 313 354
  • 206 211
  • 376 437
  • 186 195
  • 284 327
  • 453 469
  • 1 50
  • 26 373
  • 10 284
  • 410 495
  • 383 401
  • 253 372
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