Task

TAD4DN20

be887102-2dac-4103-8aca-c0f67dcd451d
Submitted at: Sept. 30, 2025, 12:30 p.m.
Task status: Finished
Number of beads: 290
Number of restraints: 470
Initial Structure type: pure random walk
Excluded volume: True
Refinement: Yes
Stiffness: 10.0 kJ/mol/rad2
Structure energy: 3911.307 kJ/mol
Beads per interaction: 0.617 beads/interaction

Up to 255 characters

Values between 0 and 100 are suitable for most cases.

Diameter of container in σ (bead diameter) units. Leave empty for modelling without this constraint.

May significantly extend computation time.

Check to include ev term

The limits are: 5 - 2000

Values between 1000 - 100 000 are usually reasonable and strongly depend on size of modelling region

Genomic region in format chrN:xxx-yyy

BEDPE format.

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arc diagram
Arc height is proportional to it's length.
Restraints
  • 2 4
  • 2 44
  • 3 5
  • 4 6
  • 4 7
  • 5 7
  • 5 8
  • 5 9
  • 5 12
  • 5 122
  • 6 11
  • 7 9
  • 7 11
  • 7 135
  • 7 137
  • 8 10
  • 8 11
  • 8 13
  • 9 11
  • 9 12
  • 9 13
  • 9 181
  • 11 13
  • 13 15
  • 13 44
  • 15 19
  • 15 44
  • 17 44
  • 18 20
  • 18 99
  • 32 44
  • 33 35
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  • 35 37
  • 35 38
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  • 39 44
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  • 44 46
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  • 106 108
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  • 108 110
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  • 114 119
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  • 115 118
  • 116 118
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  • 117 119
  • 117 120
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