Task

Rao extended

c1d393e7-e2ea-4826-bbdc-62074d3a215e
Submitted at: Sept. 17, 2025, 12:21 p.m.
Task status: Finished
Number of beads: 121
Number of restraints: 465
Initial Structure type: pure random walk
Excluded volume: True
Refinement: Yes
Stiffness: 10.0 kJ/mol/rad2
Structure energy: 1065.798 kJ/mol
Beads per interaction: 0.260 beads/interaction

Up to 255 characters

Values between 0 and 100 are suitable for most cases.

Diameter of container in σ (bead diameter) units. Leave empty for modelling without this constraint.

May significantly extend computation time.

Check to include ev term

The limits are: 5 - 2000

Values between 1000 - 100 000 are usually reasonable and strongly depend on size of modelling region

Genomic region in format chrN:xxx-yyy

BEDPE format.

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arc diagram
Arc height is proportional to it's length.
Restraints
  • 1 3
  • 1 5
  • 2 4
  • 2 5
  • 2 6
  • 2 7
  • 2 8
  • 2 9
  • 2 10
  • 2 27
  • 3 5
  • 3 6
  • 3 7
  • 4 6
  • 4 7
  • 5 7
  • 5 9
  • 6 8
  • 6 9
  • 7 9
  • 7 10
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  • 8 10
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  • 9 12
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  • 10 12
  • 10 13
  • 10 14
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